Placé sous l’autorité d’un Chef de Service, éventuellement assisté d’un Adjoint, le Service de la Comptabilité Matières est chargé :
- du traitement des comptabilités-matières;
- de la réception des fournitures et des prestations ;
- de la préparation des factures pour liquidation et certification ;
- de la préparation et de la signature des procès-verbaux de réception ;
- de la prise en charge des matières dans le livre journal ;
- de la prise en charge des services faits dans le registre des services faits ;
- de la tenue des autres documents de comptabilité matières ;
- de la gestion des stocks ;
- de la tenue des fichiers matières ;
- de la mise à jour des comptabilités mensuelles et trimestrielles ;
- de la reddition des comptes matières ;
- de l’inventaire général du matériel;
- de la confection du compte de gestion-matières et du matériel;
- de la préparation de la réforme du matériel, en liaison avec les administrations compétentes.

Il comprend les Magasins.

Chaque Magasin est placé sous l’autorité d’un Magasinier qui est chargé :
- de l’élaboration et du suivi des plannings d’approvisionnement ;
- du suivi général des activités d’approvisionnement ;
- de la démarche qualité tout au long de la livraison ;
- de la production d’un rapport des activités d’approvisionnement ;
- de la surveillance du personnel impliqué dans le circuit d’approvisionnement ;
- de la tenue des fiches de stock et de leur mise à jour quotidienne ;
- de la mise à jour quotidienne des documents inhérents à la Comptabilité-Matières.

Les Magasiniers Ad Hoc peuvent être nommés en tant que de besoin dans le cadre des projets spécifiques.